Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxxc1Q9CWW7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cxxc1Q9CWW7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cxxc1Q9CWW7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms