Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Khdc3Q9CWU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Khdc3Q9CWU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Khdc3Q9CWU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Khdc3Q9CWU5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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