Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BccipQ9CWI3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BccipQ9CWI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BccipQ9CWI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BccipQ9CWI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.8 ms