Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm26657Q9CVR1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm26657Q9CVR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm26657Q9CVR1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm26657Q9CVR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm26657Q9CVR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms