Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rprd1bQ9CSU0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rprd1bQ9CSU0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rprd1bQ9CSU0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rprd1bQ9CSU0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms