Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chchd3Q9CRB9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chchd3Q9CRB9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chchd3Q9CRB9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chchd3Q9CRB9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chchd3Q9CRB9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chchd3Q9CRB9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chchd3Q9CRB9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chchd3Q9CRB9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chchd3Q9CRB9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chchd3Q9CRB9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chchd3Q9CRB9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chchd3Q9CRB9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms