Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp5sQ9CRA7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp5sQ9CRA7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp5sQ9CRA7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp5sQ9CRA7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms