Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16,55■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,54■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,24
Tm4sf20Q9CQY8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,52■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,51■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16,5■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16,5■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,49■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,48■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16,48■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,48■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16,48■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,47■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16,47■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,47■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,46■□□□□ 0,23
Tm4sf20Q9CQY8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,46■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,45■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16,44■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,44■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16,43■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,43■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16,43■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,42■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,41■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16,41■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,4■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Tm4sf20Q9CQY8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Tm4sf20Q9CQY8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,39■□□□□ 0,21
Tm4sf20Q9CQY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,39■□□□□ 0,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms