Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifitm3Q9CQW9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifitm3Q9CQW9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ifitm3Q9CQW9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ifitm3Q9CQW9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms