Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccer1Q9CQL2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccer1Q9CQL2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccer1Q9CQL2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccer1Q9CQL2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms