Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ndufb9Q9CQJ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ndufb9Q9CQJ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms