Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16,18■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16,16■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16,15■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,15■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,15■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16,15■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Higd2aQ9CQJ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16,14■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16,14■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16,11■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16,11■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Higd2aQ9CQJ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16,07■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,06■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,3 ms