Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQ90 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQ90 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQ90 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQ90 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQ90 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQ90 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQ90 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CQ90 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CQ90 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CQ90 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CQ90 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CQ90 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CQ90 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CQ90 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CQ90 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CQ90 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CQ90 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q9CQ90 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CQ90 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CQ90 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CQ90 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9CQ90 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms