Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cadm3Q99N28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cadm3Q99N28 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cadm3Q99N28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms