Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tlr3Q99MB1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr3Q99MB1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr3Q99MB1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms