Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nus1Q99LJ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nus1Q99LJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nus1Q99LJ8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nus1Q99LJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms