Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcaf2Q921K8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcaf2Q921K8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tcaf2Q921K8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tcaf2Q921K8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcaf2Q921K8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162 ms