Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atpaf2Q91YY4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atpaf2Q91YY4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atpaf2Q91YY4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atpaf2Q91YY4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atpaf2Q91YY4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms