Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdhb12Q91Y07 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcdhb12Q91Y07 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdhb12Q91Y07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms