Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC7

Nipal2, NIPA-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipal2Q91WC7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nipal2Q91WC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nipal2Q91WC7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nipal2Q91WC7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nipal2Q91WC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms