Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE01

Dusp18, Dual specificity protein phosphatase 18, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp18Q8VE01 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dusp18Q8VE01 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dusp18Q8VE01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dusp18Q8VE01 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms