Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rdh10Q8VCH7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rdh10Q8VCH7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdh10Q8VCH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdh10Q8VCH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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