Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC74

Cox18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox18Q8VC74 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cox18Q8VC74 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cox18Q8VC74 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cox18Q8VC74 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cox18Q8VC74 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms