Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc9Q8VC31 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc9Q8VC31 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc9Q8VC31 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc9Q8VC31 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc9Q8VC31 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms