Protein–RNA interactions for Protein: Q8R480

Nup85, Nuclear pore complex protein Nup85, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup85Q8R480 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup85Q8R480 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup85Q8R480 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup85Q8R480 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup85Q8R480 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup85Q8R480 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup85Q8R480 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup85Q8R480 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup85Q8R480 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup85Q8R480 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup85Q8R480 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nup85Q8R480 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms