Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c5Q8R2T8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c5Q8R2T8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c5Q8R2T8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gtf3c5Q8R2T8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf3c5Q8R2T8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms