Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx19Q8R1Q0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx19Q8R1Q0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx19Q8R1Q0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx19Q8R1Q0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms