Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gga1Q8R0H9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gga1Q8R0H9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gga1Q8R0H9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gga1Q8R0H9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gga1Q8R0H9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms