Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Treml1Q8K558 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Treml1Q8K558 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Treml1Q8K558 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Treml1Q8K558 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.4 ms