Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Colec12Q8K4Q8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Colec12Q8K4Q8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms