Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpv3Q8K424 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trpv3Q8K424 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpv3Q8K424 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpv3Q8K424 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv3Q8K424 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms