Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HscbQ8K3A0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HscbQ8K3A0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HscbQ8K3A0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HscbQ8K3A0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HscbQ8K3A0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms