Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sash3Q8K352 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sash3Q8K352 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sash3Q8K352 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sash3Q8K352 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sash3Q8K352 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.8 ms