Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccm2Q8K2Y9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccm2Q8K2Y9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccm2Q8K2Y9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccm2Q8K2Y9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccm2Q8K2Y9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccm2Q8K2Y9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccm2Q8K2Y9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms