Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Depp1Q8K2F3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Depp1Q8K2F3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Depp1Q8K2F3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Depp1Q8K2F3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Depp1Q8K2F3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Depp1Q8K2F3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Depp1Q8K2F3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Depp1Q8K2F3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms