Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Brd3Q8K2F0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brd3Q8K2F0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd3Q8K2F0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd3Q8K2F0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms