Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scara5Q8K299 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scara5Q8K299 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scara5Q8K299 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scara5Q8K299 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scara5Q8K299 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms