Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfm1Q8K0D5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gfm1Q8K0D5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gfm1Q8K0D5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfm1Q8K0D5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms