Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LgsnQ8CIX8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LgsnQ8CIX8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LgsnQ8CIX8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LgsnQ8CIX8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1351.8 ms