Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SbsnQ8CIT9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SbsnQ8CIT9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SbsnQ8CIT9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SbsnQ8CIT9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms