Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sidt2Q8CIF6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sidt2Q8CIF6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sidt2Q8CIF6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sidt2Q8CIF6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms