Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam20aQ8CID3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam20aQ8CID3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam20aQ8CID3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam20aQ8CID3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms