Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Polr2bQ8CFI7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Polr2bQ8CFI7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr2bQ8CFI7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Polr2bQ8CFI7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2bQ8CFI7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2bQ8CFI7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2bQ8CFI7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr2bQ8CFI7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2bQ8CFI7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2bQ8CFI7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2bQ8CFI7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr2bQ8CFI7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms