Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bhlhe22Q8C6A8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bhlhe22Q8C6A8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms