Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfrp1Q8C4U3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sfrp1Q8C4U3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfrp1Q8C4U3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sfrp1Q8C4U3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms