Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim47Q8C0E3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim47Q8C0E3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim47Q8C0E3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim47Q8C0E3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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