Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVC4

Ccdc68, Coiled-coil domain-containing protein 68, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc68Q8BVC4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc68Q8BVC4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc68Q8BVC4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc68Q8BVC4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc68Q8BVC4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms