Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lmod1Q8BVA4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmod1Q8BVA4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmod1Q8BVA4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmod1Q8BVA4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmod1Q8BVA4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms