Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV3

Gphn, Gephyrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GphnQ8BUV3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GphnQ8BUV3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GphnQ8BUV3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
GphnQ8BUV3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GphnQ8BUV3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GphnQ8BUV3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GphnQ8BUV3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms