Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRM2

Gorab, RAB6-interacting golgin, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GorabQ8BRM2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GorabQ8BRM2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GorabQ8BRM2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GorabQ8BRM2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GorabQ8BRM2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GorabQ8BRM2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GorabQ8BRM2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms